抗体はアイソタイプやサブタイプに加えて、アロタイプと呼ばれる遺伝的多様性も示します。アロタイプは免疫グロブリン上の多型エピトープであり、免疫グロブリン遺伝子の対立遺伝子差異によって生じます。その結果、特定の抗体サブタイプは個人や民族間で異なることがあります。これらの多型は免疫応答に影響を与える可能性があり、非自己アロタイプに曝露されると、抗アロタイプ免疫反応を引き起こすことがあります。
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